唐玲;冷慕怡;胡征;王毅;幽门螺杆菌(Helicobacter pylori)感染是全球范围内胃炎、消化性溃疡及胃癌的重要致病因素,当前亟需开发高效疫苗以应对其公共卫生挑战。本研究基于免疫信息学方法,通过对幽门螺杆菌关键毒力因子(OipA、VacA、IceA1及HpaA)进行系统性表位筛选,构建了一种新型多表位疫苗。通过严格标准(抗原性评分>0.4、无致敏性、无毒性、与人类蛋白质无同源性),从173个细胞毒性T淋巴细胞(cytotoxic T lymphocyte, CTL; Tc cell)表位中筛选出5个高免疫原性表位,从191个辅助性T细胞(helper T cell, Th cell)表位中鉴定出6个表位,并从865个B细胞表位中确定了8个线性表位。将筛选表位与LT-ⅡB佐剂通过连接子整合,获得由421个氨基酸残基组成的多表位疫苗(分子质量44.613 k Da,理论等电点8.17),其抗原性评分为1.096 4,且稳定性与亲水性优异。结构分析显示,疫苗二级结构中α螺旋(37.055%)、β转角(7.363%)、无规卷曲(38.242%)及延伸链(17.340%)分布合理。分子对接证实,疫苗与Toll样受体(Toll-like receptor, TLR) 2/4/5/9/10可稳定结合,提示其能有效激活先天免疫。免疫模拟分析表明,该疫苗可激发强效的体液与细胞免疫应答,且理论覆盖76.18%的全球人群。此外,密码子优化后的序列成功克隆至pET-28a(+)载体,为后续实验提供了基础。综上可知,本研究构建的多表位疫苗兼具广谱保护潜力与安全性,为幽门螺杆菌疫苗研发提供了创新性设计策略,同时也为其他病原体疫苗开发提供了参考范式。
2025年05期 v.29;No.146 425-440+470页 [查看摘要][在线阅读][下载 3129K] [下载次数:102 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:9 ] 邹晓晴;李美玲;杨小雪;杨新平;微外显子(microexon)作为一类特殊的外显子,广泛存在于动物和人类的基因中,具有高度保守性,通常编码基序(motif)介导蛋白质相互作用,其可变剪接参与蛋白质相互作用网络的调控。然而,人类是否存在特异性微外显子及其是否参与疾病调控仍不明确。本研究以外显子跳读(exon skipping)这一最为常见的可变剪接事件作为切入点,通过检索8种脊椎动物基因组,成功筛选出分布在40个基因中的48个人类特异性微外显子。DECIPHER数据库的检索结果显示,在含有人类特异性微外显子的40个基因中, 97.5%(39个)存在与智力障碍表型相关的拷贝数变异。脑疾病候选基因的富集分析表明, 40个含人类特异性微外显子的基因显著富集于精神分裂症候选基因(18/40)。此外, 48个微外显子编码的基序通过与蛋白质结构域结合,介导了996个蛋白质相互作用,这些相互作用的蛋白质编码基因在精神分裂症、孤独症谱系障碍和智力障碍候选基因中显著富集。针对精神分裂症和孤独症谱系障碍患者组织转录组测序数据的进一步分析发现,超过半数的含人类特异性微外显子的基因在这两类疾病患者中存在表达异常。以上结果表明,人类特异性微外显子对人脑具有重要作用,相关突变可能与脑疾病有关。
2025年05期 v.29;No.146 441-453页 [查看摘要][在线阅读][下载 1485K] [下载次数:54 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:5 ]